O Brasil é um dos principais produtores e exportadores de algodão do mundo. Atualmente, é o quarto maior produtor e o segundo maior exportador dessa fibra natural. O cultivo de algodão em larga escala no Brasil iniciou-se a partir dos anos 70, cuja produção era concentrada nas regiões sudeste e sul até os anos 90, com uma média de 626,6 e 706,1 mil toneladas de algodão em caroço, respectivamente, até a safra de 1991/1992.

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A partir dessa época houve uma redução drástica da produção de algodão nessas regiões e um aumento na região centro-oeste, que até os anos 91/92 produzia em média 178,5 mil toneladas. Esse aumento se deu pela expansão da agricultura nessa região, o que resultou no aumento da área cultivada de algodão, principalmente no estado de Mato Grosso.

O aumento da área de cultivo se deu pelo desenvolvimento de novas cultivares e de tecnologias para facilitar o manejo e aumentar a produtividade das lavouras. Na década de 1980, as fazendas do Cerrado, que representam mais de 90% da produção nacional, iniciaram o cultivo de algodão utilizando cultivares desenvolvidas por parcerias de cotonicultores e programas do governo. Foram inseridas no mercado cultivares com resistência a doenças, pragas e até mesmo a herbicidas.

Além disso, a colheita do algodão passou a ser mecanizada, o que permitiu as fazendas aumentarem suas áreas de produção. Antigamente, a maioria das fazendas produtoras de algodão eram menores que 100 ha, e hoje, mais da metade são maiores que 1000 ha. Atualmente, Mato Grosso e Bahia tem as maiores áreas plantadas, com 1,14 e 0,307 milhões de ha cultivados com algodão, respectivamente, representando 90% da área cultivada no país.

A região do cerrado apresenta inúmeras vantagens para a produção de algodão quando comparadas à região sudeste e sul do Brasil, principalmente pela topografia, que facilitou a mecanização e também pela colheita coincidir com clima seco e temperaturas mais adequadas para o algodão.

A partir dos anos 2000, a produção em média de algodão em caroço na região centro-oeste foi de 1,84 milhões de toneladas, e nas últimas três safras a produção foi superior a 4,8 milhões de toneladas. Do total produzido nessa região nas últimas safras mais de 90% foram no estado do Mato Grosso e o restante no Mato Grosso do Sul e Goiás.

No nordeste brasileiro, atualmente o maior produtor de algodão é a Bahia, que teve uma enorme crescente na sua produção a partir da safra 2003/2004, produzindo acima de 600 toneladas de algodão em caroço. Nas últimas três safras, o Nordeste produziu 1.59 mil toneladas em média, e a Bahia foi responsável por 88% dessa produção, que também abrange os estados do Maranhão, Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte e Pernambuco.

A produção de algodão no Brasil atingiu na última safra (2020/2021) 5,79 milhões de toneladas de algodão em caroço, segundo a Conab, e a expectativa de produção na safra atual é em um aumento de quase 20% com os estados de MT e BA produzindo 90% da produção nacional.